Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMP1P11279 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms