Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG8P0DPA2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms