Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4BP0C0L5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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