Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGAP02671 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGAP02671 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGAP02671 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGAP02671 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGAP02671 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGAP02671 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGAP02671 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGAP02671 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGAP02671 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGAP02671 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGAP02671 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGAP02671 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGAP02671 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGAP02671 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGAP02671 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGAP02671 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGAP02671 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGAP02671 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGAP02671 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGAP02671 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGAP02671 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGAP02671 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGAP02671 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms