Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX7O95931 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CBX7O95931 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CBX7O95931 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CBX7O95931 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CBX7O95931 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CBX7O95931 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX7O95931 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms