Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYF2O95926 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYF2O95926 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYF2O95926 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYF2O95926 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms