Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX58O95786 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX58O95786 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX58O95786 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX58O95786 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX58O95786 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX58O95786 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX58O95786 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX58O95786 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX58O95786 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX58O95786 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX58O95786 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX58O95786 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms