Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UFL1O94874 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFL1O94874 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFL1O94874 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UFL1O94874 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFL1O94874 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFL1O94874 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFL1O94874 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFL1O94874 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFL1O94874 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFL1O94874 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFL1O94874 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFL1O94874 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UFL1O94874 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UFL1O94874 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UFL1O94874 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UFL1O94874 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UFL1O94874 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms