Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKAP2O75563 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP2O75563 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms