Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP4O75379 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms