Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCN2BO60939 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms