Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB3O43889 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB3O43889 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB3O43889 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB3O43889 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB3O43889 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CREB3O43889 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREB3O43889 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREB3O43889 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB3O43889 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms