Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms