Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms