Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms