Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTIFO43310 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTIFO43310 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTIFO43310 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTIFO43310 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTIFO43310 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTIFO43310 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTIFO43310 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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