Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms