Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCKDKO14874 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms