Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP23O00161 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms