Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3KT08 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
J3KT08 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
J3KT08 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
J3KT08 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms