Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BQV1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BQV1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQV1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BQV1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BQV1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BQV1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BQV1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms