Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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