Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNOT1A5YKK6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms