Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF22A3QJZ6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms