Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC144AA2RUR9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144AA2RUR9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms