Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC78A2IDD5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms