Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms