Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYG3

TRBV6-8, T-cell receptor beta variable 6-8 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-8A0A0A6YYG3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV6-8A0A0A6YYG3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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