Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
A0A087WWV3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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