Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 CPNE8-201ENST00000331366 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 POM121-204ENST00000446813 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF529-201ENST00000334116 5238 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FAT3-206ENST00000533797 7894 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IREB2-208ENST00000560440 4396 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP4A22-207ENST00000620131 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TOX4-203ENST00000448790 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PDCD4-202ENST00000393104 3697 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZDHHC15-203ENST00000541184 6012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LAMC2-201ENST00000264144 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM111A-211ENST00000533703 4202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PXYLP1-202ENST00000393010 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 USP20-203ENST00000372429 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TIMELESS-201ENST00000229201 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MPP2-201ENST00000269095 4414 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH4-202ENST00000611855 3304 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 VWA3B-213ENST00000477737 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHGA10-201ENST00000398610 4617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PAK5-203ENST00000378429 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DKK2-201ENST00000285311 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PRPF38B-201ENST00000370021 3728 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SERHL2-202ENST00000335879 753 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA64.2-201ENST00000362696 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 COX17P1-201ENST00000378775 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR711-201ENST00000390201 76 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TRBV6-5-201ENST00000390368 410 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC119428.1-201ENST00000429099 383 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL159P-201ENST00000485164 292 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CUTA-211ENST00000488478 676 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FTH1P23-201ENST00000492727 550 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ALG1L12P-201ENST00000515046 434 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC069287.2-201ENST00000526963 574 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms