Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ELF5-201ENST00000257832 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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MKRN4PQ13434 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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MKRN4PQ13434 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
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MKRN4PQ13434 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC8.28□□□□□ -1.08
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MKRN4PQ13434 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
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MKRN4PQ13434 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
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MKRN4PQ13434 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
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MKRN4PQ13434 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN4PQ13434 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
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MKRN4PQ13434 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
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MKRN4PQ13434 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
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MKRN4PQ13434 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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MKRN4PQ13434 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN4PQ13434 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
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