Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF557-202ENST00000414706 5736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ACAD10-201ENST00000313698 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 B4GALT6-202ENST00000306851 3891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MCC-209ENST00000515367 3844 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 DYRK4-211ENST00000540757 3272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 HERC2P8-202ENST00000564334 3705 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 LHX9-203ENST00000367390 7413 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 CLUAP1-212ENST00000576634 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 PAPD4-201ENST00000296783 3129 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 GRIA1-201ENST00000285900 5708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 C1orf74-201ENST00000294811 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 USP28-201ENST00000003302 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF160-214ENST00000601421 4688 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 METTL4-201ENST00000319888 3601 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 EDNRA-201ENST00000324300 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 DPH3-202ENST00000383775 3052 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF469-201ENST00000437464 13203 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00402-201ENST00000419499 3340 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 SIRT5-201ENST00000359782 3797 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 TTLL7-201ENST00000260505 7976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 CD163L1-202ENST00000416109 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 ARHGEF9-222ENST00000636048 5059 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 ATP8A2-204ENST00000381655 9575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 PIBF1-201ENST00000326291 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 CDC42SE1-207ENST00000540998 3181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 DMBT1-202ENST00000338354 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 DMBT1-204ENST00000368909 7686 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 DMBT1-207ENST00000619379 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 MXRA5-201ENST00000217939 9793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 CARMN-201ENST00000505254 3950 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 GOSR2-232ENST00000640051 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 IL1R1-203ENST00000409589 3544 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 FMN1-207ENST00000559047 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU1-11P-201ENST00000383975 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 AC013399.1-201ENST00000450311 418 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 RN7SL74P-201ENST00000464966 299 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP2-2Q9BYT5 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms