Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC140658.6-201ENST00000603958 201 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 UQCRC2-213ENST00000630839 535 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ACSL6-203ENST00000379240 2548 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MYO1A-203ENST00000442789 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 UBE2V1-206ENST00000415862 2387 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 COL10A1-202ENST00000327673 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 OR2B11-203ENST00000641527 4545 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 GREB1L-201ENST00000269218 5600 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 GLE1-201ENST00000309971 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 KPNA5-201ENST00000356348 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 C2orf42-205ENST00000420306 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01572-201ENST00000561611 2194 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NELL2-202ENST00000395487 3203 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 EFHC1-226ENST00000636954 2129 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC24A1-211ENST00000544319 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MRNIP-204ENST00000518219 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 HRH2-204ENST00000636584 4067 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TPTE-201ENST00000427445 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PTK2B-210ENST00000517339 3914 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CXorf57-202ENST00000372548 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PFKFB1-202ENST00000375006 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 EXOC7-202ENST00000335146 3519 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TRIM53BP-201ENST00000532912 1720 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SV2C-202ENST00000502798 11035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TMEM246-201ENST00000374847 4223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 POLR3B-202ENST00000539066 4118 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MINDY3-201ENST00000277632 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF608-203ENST00000504926 4726 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01915-201ENST00000577994 2321 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 POLR1B-203ENST00000409894 4457 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LCOR-209ENST00000540664 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01193-201ENST00000553416 3401 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 BHLHB9-205ENST00000457056 4082 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.7 ms