Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 C1orf147-201ENST00000367119 2096 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KRT18P59-202ENST00000534728 3338 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LANCL1-207ENST00000450366 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DERL2-201ENST00000158771 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KCTD19-201ENST00000304372 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 HIST1H4H-201ENST00000377727 397 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR25-201ENST00000384816 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IGLV3-32-201ENST00000390303 383 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TDGF1P4-201ENST00000401555 520 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009494.1-201ENST00000406090 455 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC145543.1-201ENST00000424770 586 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL12P14-201ENST00000431782 490 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CRIP1P4-201ENST00000442565 229 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KRTAP19-10P-201ENST00000445258 187 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DCD-202ENST00000456047 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP414-201ENST00000516580 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01605-202ENST00000519738 733 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GEMIN8P2-201ENST00000569855 700 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TNFAIP3-208ENST00000615468 3818 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC138894.4-201ENST00000616703 256 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016292.2-201ENST00000618967 210 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC145285.8-201ENST00000619561 255 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 POLR2J3-221ENST00000621093 348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6754-201ENST00000621121 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CU638689.2-201ENST00000623809 818 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GLOD4-219ENST00000628529 111 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC078776.2-201ENST00000641021 285 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP2B2-201ENST00000352432 8593 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EZH2-205ENST00000476773 2572 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4697HG-201ENST00000624667 5164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TGFA-201ENST00000295400 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LMO7-201ENST00000321797 5647 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SV2C-202ENST00000502798 11035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL133492.1-201ENST00000617854 3955 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 POLR2M-202ENST00000380557 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CDV3-202ENST00000420115 3621 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IRF5-208ENST00000473745 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LPA-202ENST00000447678 1839 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZAN-205ENST00000613979 8669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS4A-201ENST00000254950 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DDX4-201ENST00000353507 2778 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SEPT3-202ENST00000396425 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.8 ms