Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO7B-202ENST00000409816 6694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PIPSL-201ENST00000480546 3350 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 STIL-202ENST00000360380 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MPP2-218ENST00000536246 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NELL1-203ENST00000357134 3022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MAOA-201ENST00000338702 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AOC3-206ENST00000613571 3900 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN30-202ENST00000420878 4323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF438-207ENST00000452305 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0907-202ENST00000368320 4499 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DHDDS-202ENST00000360009 3245 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR155-202ENST00000392551 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MEIS2-205ENST00000397624 2748 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR12P-201ENST00000413515 2706 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CALCR-205ENST00000421592 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NLGN4X-208ENST00000538097 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EAF1-201ENST00000396842 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025279.1-201ENST00000604430 4818 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SETD4-201ENST00000332131 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KA1-216ENST00000530003 3023 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC16-203ENST00000375849 3446 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM94-202ENST00000375248 4703 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L4A-211ENST00000621003 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SMAP2-205ENST00000539317 2501 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL22-207ENST00000523037 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN6-206ENST00000376496 2922 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 VAC14-AS1-202ENST00000562507 4853 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 IRAK2-201ENST00000256458 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TSGA10-203ENST00000393483 3878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.5 ms