Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZBED1O96006 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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