Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SERP1Q9Y6X1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms