Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KPTNQ9Y664 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KPTNQ9Y664 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KPTNQ9Y664 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KPTNQ9Y664 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KPTNQ9Y664 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KPTNQ9Y664 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KPTNQ9Y664 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KPTNQ9Y664 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KPTNQ9Y664 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KPTNQ9Y664 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KPTNQ9Y664 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KPTNQ9Y664 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KPTNQ9Y664 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms