Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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