Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DTX4Q9Y2E6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX4Q9Y2E6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms