Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX6Q9UPM6 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms