Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFSF18Q9UNG2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms