Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms