Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA3Q9UI47 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA3Q9UI47 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms