Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DBF4Q9UBU7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms