Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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