Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC4Q9UBN4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms