Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

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Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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COL20A1Q9P218 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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COL20A1Q9P218 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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COL20A1Q9P218 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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COL20A1Q9P218 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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COL20A1Q9P218 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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COL20A1Q9P218 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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COL20A1Q9P218 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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COL20A1Q9P218 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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COL20A1Q9P218 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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COL20A1Q9P218 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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COL20A1Q9P218 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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