Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms