Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALKBH4Q9NXW9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms